Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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