Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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NPRL3Q12980 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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NPRL3Q12980 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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NPRL3Q12980 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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NPRL3Q12980 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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