Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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