Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms