Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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