Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TROQ12816 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TROQ12816 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TROQ12816 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TROQ12816 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TROQ12816 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TROQ12816 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TROQ12816 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TROQ12816 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TROQ12816 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TROQ12816 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TROQ12816 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TROQ12816 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TROQ12816 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TROQ12816 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TROQ12816 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TROQ12816 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TROQ12816 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TROQ12816 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TROQ12816 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TROQ12816 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TROQ12816 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TROQ12816 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TROQ12816 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TROQ12816 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TROQ12816 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TROQ12816 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TROQ12816 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TROQ12816 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TROQ12816 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms