Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms