Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms