Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms