Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms