Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1T1Q06455 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms