Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms