Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms