Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms