Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPCQ03188 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms