Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLOD1Q02809 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms