Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DSC2Q02487 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms