Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms