Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms