Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK17Q00537 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK17Q00537 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms