Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFAMQ00059 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms