Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2FP61218 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2FP61218 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2FP61218 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2FP61218 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2FP61218 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2FP61218 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2FP61218 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2FP61218 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR2FP61218 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2FP61218 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms