Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME5P56597 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NME5P56597 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NME5P56597 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME5P56597 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms