Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTBP2P56545 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms