Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms