Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF10P55107 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF10P55107 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF10P55107 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF10P55107 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF10P55107 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF10P55107 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF10P55107 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF10P55107 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF10P55107 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF10P55107 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF10P55107 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF10P55107 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDF10P55107 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms