Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA8P53708 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA8P53708 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA8P53708 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA8P53708 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA8P53708 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA8P53708 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA8P53708 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA8P53708 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA8P53708 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA8P53708 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms