Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRXP46100 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRXP46100 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRXP46100 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms