Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARL1P40616 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARL1P40616 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARL1P40616 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARL1P40616 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARL1P40616 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARL1P40616 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARL1P40616 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARL1P40616 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms