Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF4P34130 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTF4P34130 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTF4P34130 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTF4P34130 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms