Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD34P28906 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD34P28906 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms