Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DUSP1P28562 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms