Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXP28300 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXP28300 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LOXP28300 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LOXP28300 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LOXP28300 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LOXP28300 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms