Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms