Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTX3P26022 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTX3P26022 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTX3P26022 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTX3P26022 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTX3P26022 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTX3P26022 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTX3P26022 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTX3P26022 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTX3P26022 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTX3P26022 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTX3P26022 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTX3P26022 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms