Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNCP24863 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNCP24863 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNCP24863 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNCP24863 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNCP24863 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNCP24863 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNCP24863 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNCP24863 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNCP24863 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNCP24863 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNCP24863 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNCP24863 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNCP24863 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNCP24863 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNCP24863 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNCP24863 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNCP24863 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNCP24863 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNCP24863 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNCP24863 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNCP24863 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNCP24863 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNCP24863 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms