Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRKCHP24723 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRKCHP24723 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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