Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSR1P21757 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSR1P21757 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSR1P21757 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSR1P21757 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSR1P21757 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms