Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMNB1P20700 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNB1P20700 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNB1P20700 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNB1P20700 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms