Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms