Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB1P18505 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms