Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ETFAP13804 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ETFAP13804 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ETFAP13804 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETFAP13804 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETFAP13804 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ETFAP13804 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms