Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRG2P13727 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms