Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms