Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEFHP12036 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEFHP12036 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms