Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms