Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GLI4P10075 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI4P10075 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI4P10075 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI4P10075 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI4P10075 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI4P10075 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI4P10075 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GLI4P10075 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms