Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RGPD2P0DJD1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD2P0DJD1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms