Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ89

DUX4L6, Double homeobox protein 4-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L6P0CJ89 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4L6P0CJ89 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms