Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB1P04280 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB1P04280 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB1P04280 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB1P04280 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB1P04280 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB1P04280 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB1P04280 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB1P04280 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB1P04280 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB1P04280 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRB1P04280 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms